学校为全日制硕士生提供各类奖助学金，具体如下：
（一）国家助学金
每生6000元/学年，国家助学金覆盖面为100%（有固定工资收入的学生除外）。
（二）国家奖学金
根据上级主管部门分配的名额，表现特别优异的研究生可申请研究生国家奖学金，奖励标准为每生20000元/学年。
（三）曲阜师范大学研究生学业奖学金
为奖励支持表现良好的研究生更好地完成学业，学校设立研究生学业奖学金（有固定工资收入的学生除外），分为一、二、三等奖：一等学业奖学金，奖励标准为8000元；二等学业奖学金，奖励标准为6000元；三等学业奖学金，奖励标准为5000元。
（四）其他
1.在校生还可申请校级优秀研究生奖学金、校级优秀研究生干部奖学金、校级优秀毕业研究生奖学金、研究生“圣地英才奖”、“华藏奖学金”、“京华奖学金”、“‘党员之助’奖学金”以及研究生学位论文科研创新资助基金等。
2.学校设立“三助”岗位，在“三助”岗位工作的在校生学校每月发放400元的津贴；家庭经济困难的在校生，经申请和认定后，学校一次性发放困难补贴；经济困难学生亦可申请生源地信用助学贷款，最高额度不超过12000元/学年。
3.学校提供专项资金支持研究生参加国内外的学术讨论交流活动。